현물가격과 선물가격의 차인 베이시스가 변동하는 위험을 말한다. 현물가격과 선물가격은 기본적 으로 같은 방향으로 움직이며 거의 일정한 비율을 움직이며 거의 일정한 비율을 유지하게 된다. 그러나 순보관비용의 변동이나 미래의 이자율 수준에 대한 예상치 못한 정보 등이 유입될 경우 현물가격과 선물가격의 차이는 상이한 변화패턴을 보이는 것이 일반적이다. 이러한 베이시스 위험의 존재는 계약청산시점에서의 베이스가 예약체결시점에서의 베이시스와 다 르게 되는 결과를 초래하게 되어 헷지결과에 영향을 주게 된다. 한편 파생금융상품을 이용한 헷지거래시 불완전한 헷지거래를 할 경우 헷지거래를 할 경우 헷지대상 의 가격변동과 헷지거래의 가격변동 차이로 인해 시장리스크가 존재하게 되는데, 이러한 불완전한 헷지로 인해 발생하는 위험을 베이시스 위험이라고도 한다.
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